[地形地貌] 南通开发区地处江海平原，平均标高（吴淞高程）4.45米左右，土层深厚，土壤肥沃。
[工程地质] 南通开发区工程持力层在20米以下，地基容许承载力一般在8-13吨/平方米，深层岩（55米以下）稳定，属工程地质良好区。
[水文地质] 南通开发区紧靠长江，无暗沟暗塘。地下深井水分三层，第一承压含水层，埋深较浅，已与地表水联成一体；第二承压含水层，埋深在160米左右，水质较差，水量也不够丰富；第三承压含水层，埋深在220-250米，水质较好，水量丰富，是主要的开采层。

[气候条件] 南通开发区属亚热带湿润季风气候区。气候温和，四季分明。年平均气温14.9℃，平均地表温度17.6℃,年平均降水量1066.8毫米，年平均蒸发量1341.9毫米，年平均气压1016毫巴，年平均日照2144小时。与同纬度的季风气候区相比，这里光照充足，光、热、温、水协调，空气清新，气候宜人。
[环境质量] 南通开发区所在地环境质量良好，生态平衡正常。长江水质、内河水质、潜水水质均较好；对大气中的二氧化硫、氨氧化物和悬浮物监测结果表明，大气环境达到国家规定的一级标准；环境噪声为43.5分贝，低于城市区域环境噪声标准中特殊居住区45分贝的国家规定，环境幽静；环境放射性天然本底（r射线）平均值为17.5微伦/时，本底状况良好，未受人为放射性污染。